Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col26a1Q91VF6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms