Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Capn8Q91VA3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms