Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SelenomQ8VHC3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms