Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20aQ8VDB9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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