Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8VCE4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VCE4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8VCE4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms