Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dnajc28Q8VCE1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc28Q8VCE1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms