Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clptm1Q8VBZ3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clptm1Q8VBZ3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms