Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClmpQ8R373 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms