Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnaaf4Q8R368 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms