Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1M2

H2afj, Histone H2A.J, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afjQ8R1M2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2afjQ8R1M2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2afjQ8R1M2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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