Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b4Q8QZY9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b4Q8QZY9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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