Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hoxc12Q8K5B8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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