Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec12Q8K4Q8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms