Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pitrm1Q8K411 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms