Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Casc3Q8K3W3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Casc3Q8K3W3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Casc3Q8K3W3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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