Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vmn1r72Q8K3N7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms