Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r188Q8K3N2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms