Protein–RNA interactions for Protein: Q8K387

Usp45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp45Q8K387 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp45Q8K387 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms