Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Brd3Q8K2F0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms