Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms