Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Polr1eQ8K202 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms