Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sde2Q8K1J5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sde2Q8K1J5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms