Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc47a1Q8K0H1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms