Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms