Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms