Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mterf1aQ8CHZ9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms