Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ep400Q8CHI8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ep400Q8CHI8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.6 ms