Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Csnka2ipQ8CH19 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Csnka2ipQ8CH19 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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