Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc43a2Q8CGA3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc43a2Q8CGA3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc43a2Q8CGA3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc43a2Q8CGA3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc43a2Q8CGA3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc43a2Q8CGA3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc43a2Q8CGA3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc43a2Q8CGA3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Slc43a2Q8CGA3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms