Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx8Q8CFD4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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