Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc17Q8CE13 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms