Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CrebrfQ8CDG5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CrebrfQ8CDG5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms