Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prpf31Q8CCF0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms