Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ephb1Q8CBF3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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