Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slfn5Q8CBA2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms