Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppfibp1Q8C8U0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms