Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8E0

Gm13199, Predicted gene 13199, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13199Q8C8E0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm13199Q8C8E0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms