Protein–RNA interactions for Protein: Q8C850

Scara3, Scavenger receptor class A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara3Q8C850 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scara3Q8C850 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms