Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp20Q8C6M1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp20Q8C6M1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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