Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms