Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Snx16Q8C080 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Snx16Q8C080 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Snx16Q8C080 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Snx16Q8C080 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Snx16Q8C080 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Snx16Q8C080 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Snx16Q8C080 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Snx16Q8C080 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Snx16Q8C080 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx16Q8C080 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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