Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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