Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVM7

Als2cr12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2cr12Q8BVM7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Als2cr12Q8BVM7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms