Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcl3Q8BVF2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcl3Q8BVF2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms