Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps6kb1Q8BSK8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms