Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSA9

Tyw3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyw3Q8BSA9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tyw3Q8BSA9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms