Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxo38Q8BMI0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxo38Q8BMI0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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