Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grik4Q8BMF5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik4Q8BMF5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms