Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp1Q8BJQ2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp1Q8BJQ2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms