Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ83

Tm2d3, TM2 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d3Q8BJ83 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d3Q8BJ83 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d3Q8BJ83 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d3Q8BJ83 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d3Q8BJ83 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d3Q8BJ83 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d3Q8BJ83 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d3Q8BJ83 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d3Q8BJ83 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d3Q8BJ83 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d3Q8BJ83 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d3Q8BJ83 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d3Q8BJ83 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d3Q8BJ83 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d3Q8BJ83 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d3Q8BJ83 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d3Q8BJ83 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d3Q8BJ83 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d3Q8BJ83 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d3Q8BJ83 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d3Q8BJ83 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tm2d3Q8BJ83 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tm2d3Q8BJ83 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms